樹木園占地23000平方米，分木蘭科區、珍稀瀕危植物區、經濟林區、森林植物區，共移植栽培各類植物81屬2551種，20000多株，其中珍稀瀕危植物112種，國家一級保護植物23種，二級保護樹種25種，充分反映了云南植物資源的豐富性和多樣性，以及我國對珍稀、瀕危植物有效的保護成就在漫長的歷史長河中，人類利用樹木創造了與之相關的燦爛物質文化。

樹木園主要展示我國對珍稀、瀕危植物的保護成就，樹木園門口的翠柏，樹齡300多年，樹高13.8米胸徑1.1米，是從70公里外的安寧市移栽入園的創下了世界柏科植物移栽的新紀錄。

樹木園中種植了以華蓋木為主的木蘭科植物50多種，且多為大樹，實屬罕見。云南作為世界森林種質資源最豐富的區域特點以及云南在世界木蘭科植物研究的地位和所起到的作用。據統計全世界共有木蘭科植物15個屬150多種，云南就有11個屬120種。珍稀瀕危植物栽培區有10多種國家一級保護植物，如琪桐、云南紅豆杉、禿杉、花色金黃的金茶花和稱為恐龍食物的秒櫻樹。